鲤洼学园侦探部副部长雾峰凉正拜托怪人老师石崎浩见担当侦探部顾问时，同班同学奈绪子跑了过来。说是田径部的足立骏介倒在沙地上了。嗅到案件味道的凉飞奔向现场。足立说是被人从背后打了。沙地上留下了两个人的脚印。一个是足立自己的，另一个是第一发现人奈绪子的。足立认为犯人是奈子，可是从位置关系来看不可能是她。石崎也突然说出“犯人不是人”。那么到底犯人是什么呢？当天夜晚，在石崎主办的流星观测会上，天空出现了奇怪的绿色飞行体。石崎叫喊道“是UFO”，并跑了出去。石崎和凉飞车追随着向X山方向远去的绿光。看丢了UFO的石崎他们却发现了倒在地里的女性。那是宠物商店的店员恭子。乌山千岁和部下祖师古大藏开着警车来到现场。可是，现场也只留下了被害人的足迹。那么，没有足迹的连续杀人犯是外星人吗？消失的UFO去了哪里呢？